‘First contact’ that may have led to complex life on Earth finally witnessed by scientists
,

‘Kontak pertama’ yang mungkin mengarah pada kehidupan kompleks di Bumi akhirnya disaksikan oleh para ilmuwan

‘First contact’ that may have led to complex life on Earth finally witnessed by scientists

Brendan Paul Burns, Associate Professor, School of Biotech & Biomolecular Science, UNSW Sydney Kymberley Oakley, Indigenous language expert, Indigenous Knowledge

Stromatolites might look like rocks. But they are living relics of ancient systems that thrived on Earth billions of years ago.

Stromatolit mungkin terlihat seperti batu. Tetapi mereka adalah relik hidup dari sistem kuno yang berkembang di Bumi miliaran tahun yang lalu.

On the shores of the west coast of Australia lies a window to our past: the stromatolites and microbial mats of Gathaagudu (Shark Bay).

Di pantai barat Australia terdapat jendela menuju masa lalu kita: stromatolit dan tikar mikroba Gathaagudu (Shark Bay).

To the untrained eye they look like a collection of rocks and slime – but they are in fact teeming with microbial life. And these stromatolites are living “relics” of ancient ecosystems that thrived on Earth billions of years ago.

Bagi mata yang tidak terlatih, mereka terlihat seperti kumpulan batu dan lendir – tetapi pada kenyataannya, mereka dipenuhi kehidupan mikroba. Dan stromatolit ini adalah “sisa” hidup dari ekosistem kuno yang berkembang di Bumi miliaran tahun yang lalu.

If you wade past, it feels like you’re walking back through time. In fact, the first bubbles of oxygen that filled the atmosphere on early Earth likely came from ancient stromatolites. You could say we owe our very existence to these piles of rocks.

Jika Anda berjalan melewatinya, rasanya seperti berjalan kembali melalui waktu. Faktanya, gelembung oksigen pertama yang mengisi atmosfer di Bumi awal kemungkinan berasal dari stromatolit kuno. Dapat dikatakan bahwa keberadaan kita sangat bergantung pada tumpukan batu ini.

So, what other secrets of our past could these ecosystems tell us? Through decades of research, we know how early life has woven its path through these “living rocks”. But most recently our team embarked on the greatest genealogy search of them all: searching for our great microbial ancestors, the Asgard archaea.

Jadi, rahasia masa lalu apa lagi yang bisa diceritakan oleh ekosistem ini? Selama puluhan tahun penelitian, kami tahu bagaimana kehidupan awal menenun jalurnya melalui “batu hidup” ini. Namun baru-baru ini tim kami memulai pencarian silsilah terbesar dari semuanya: mencari nenek moyang mikroba kita, archaea Asgard.

And in a new paper, published today in the journal Current Biology, we report how this search led to the discovery of a key clue that could help explain how complex life evolved on Earth.

Dan dalam makalah baru, yang diterbitkan hari ini di jurnal Current Biology, kami melaporkan bagaimana pencarian ini mengarah pada penemuan petunjuk kunci yang dapat membantu menjelaskan bagaimana kehidupan kompleks berevolusi di Bumi.

Figure
A field of stromatolites in Shark Bay, Western Australia. Brendan Burns
Sebuah ladang stromatolit di Shark Bay, Australia Barat. Brendan Burns Brendan Burns

The cells that comprise complex life

Sel-sel yang menyusun kehidupan kompleks

Asgard archaea were originally named after Norse gods. This fascinating group of microbes sits on the cusp of one of the most significant events in the evolution of life: the origin of the complex cells that make up plants and animals, known as eukaryotes.

Archaea Asgard awalnya dinamai berdasarkan dewa Nordik. Kelompok mikroba yang menarik ini berada di ambang salah satu peristiwa paling signifikan dalam evolusi kehidupan: asal usul sel kompleks yang membentuk tumbuhan dan hewan, yang dikenal sebagai eukariota.

Evidence suggests Asgard archaea are the closest relatives of eukaryotes. And that on an early Earth it was the “marriage” of an ancient Asgard archaeon and a bacterium that led to the first eukaryotes.

Bukti menunjukkan bahwa archaea Asgard adalah kerabat terdekat eukariota. Dan bahwa di Bumi awal, adalah “pernikahan” antara archaeon Asgard kuno dan bakteri yang mengarah pada eukariota pertama.

They formed an ancient partnership. They shared resources and physically interacted, leading to the first complex cells. Like a Romeo and Juliet tale of two distant families coming together, Asgard archaea and bacteria decided it was time to break from traditional family values.

Mereka membentuk kemitraan kuno. Mereka berbagi sumber daya dan berinteraksi secara fisik, yang mengarah pada sel kompleks pertama. Seperti kisah Romeo dan Juliet tentang dua keluarga jauh yang bersatu, archaea Asgard dan bakteri memutuskan bahwa sudah waktunya untuk melepaskan diri dari nilai-nilai keluarga tradisional.

But we have never seen a model of how this may have occurred. Until now.

Tetapi kita belum pernah melihat model bagaimana ini mungkin terjadi. Sampai sekarang.

Holding up a mirror to the ancient past

Menampilkan cermin masa lalu yang kuno

Our team used the mats of Shark Bay as a “seed” to establish cultures of these ancient microbes. We are one of only four groups worldwide to achieve this, through years of research with a dedicated team of graduate students nurturing the Asgards like offspring.

Tim kami menggunakan tikar Shark Bay sebagai “benih” untuk membangun kultur mikroba kuno ini. Kami adalah salah satu dari empat kelompok di seluruh dunia yang berhasil mencapai hal ini, melalui penelitian bertahun-tahun dengan tim mahasiswa pascasarjana yang berdedikasi memelihara Asgard seperti keturunan.

But the Asgards were not alone. We found them together with a sulphate-loving bacterium. Could this be a model of how complex life may have started on a primitive Earth?

Namun, Asgard tidak sendirian. Kami menemukan mereka bersama dengan bakteri pencinta sulfat. Mungkinkah ini menjadi model bagaimana kehidupan kompleks mungkin dimulai di Bumi purba?

We began by sequencing the Asgards’ DNA to decipher exactly how these microbes tick at the genetic level. We also used artificial intelligence to model how proteins could have behaved in a world before eukaryotes. Evidence suggested these two microbes were sharing nutrients. In other words, they were cooperating.

Kami memulai dengan sekuensing DNA Asgard untuk menguraikan secara tepat bagaimana mikroba ini berfungsi pada tingkat genetik. Kami juga menggunakan kecerdasan buatan untuk memodelkan bagaimana protein dapat berperilaku di dunia sebelum eukariota. Bukti menunjukkan kedua mikroba ini berbagi nutrisi. Dengan kata lain, mereka bekerja sama.

But we wanted to delve deeper. What do our great microbial ancestors look like? Here we turned to electron cryotomography, a high-resolution imaging approach that allowed us to observe cells and structures at a nanometre scale.

Namun, kami ingin menggali lebih dalam. Seperti apa nenek moyang mikroba kita? Di sini kami beralih ke kriotomografi elektron, pendekatan pencitraan resolusi tinggi yang memungkinkan kami mengamati sel dan struktur pada skala nanometer.

And here we showed – for the first time – an Asgard archaeon and a bacterium directly interacting. Tiny nanotubes were connecting the two organisms – perhaps reflecting what their great-ancestors did on an early Earth that ultimately led to the explosion of complex life as we know it.

Dan di sini kami menunjukkan – untuk pertama kalinya – arkeon Asgard dan bakteri yang berinteraksi secara langsung. Nanotube kecil menghubungkan kedua organisme tersebut – mungkin mencerminkan apa yang dilakukan nenek moyang mereka di Bumi awal yang pada akhirnya mengarah pada ledakan kehidupan kompleks seperti yang kita ketahui.

Figure
Microbial mat from Gathaagudu (Shark Bay, Australia). Inset: Microscopic image showing Asgard archaeon and bacterium derived from these mats interacting as a model for evolution of complex cells. Iain Duggin/Bindusmita Paul/Debnath Ghosal/Matthew Johnson/Brendan Burns.
Tikar mikroba dari Gathaagudu (Shark Bay, Australia). Sisipan: Gambar mikroskopis yang menunjukkan arkeon Asgard dan bakteri yang berasal dari tikar ini berinteraksi sebagai model evolusi sel kompleks. Iain Duggin/Bindusmita Paul/Debnath Ghosal/Matthew Johnson/Brendan Burns. Iain Duggin/Bindusmita Paul/Debnath Ghosal/Matthew Johnson/Brendan Burns.

Weaving western science with Indigenous knowledge

Menjalin ilmu pengetahuan barat dengan pengetahuan Adat

This was a major discovery – one that originated in Gathaagudu, a World Heritage Site with significant environmental and cultural values.

Ini adalah penemuan besar – yang berasal dari Gathaagudu, Situs Warisan Dunia dengan nilai lingkungan dan budaya yang signifikan.

Aboriginal people first inhabited Gathaagudu over 30,000 years ago. We wanted to recognise and celebrate the language of the Malgana people, one of the traditional language groups of Gathaagudu. We also wanted to connect western science with Indigenous Knowledge in a meaningful way.

Penduduk asli pertama kali menghuni Gathaagudu lebih dari 30.000 tahun yang lalu. Kami ingin mengakui dan merayakan bahasa masyarakat Malgana, salah satu kelompok bahasa tradisional Gathaagudu. Kami juga ingin menghubungkan ilmu pengetahuan barat dengan Pengetahuan Adat dengan cara yang bermakna.

To this end and working closely with the world’s foremost Malgana language expert, Kymberley Oakley, and Aboriginal elders, a name was granted for our novel Asgard archaeon from the language of the Malgana people: Nerearchaeum marumarumayae. The species name – marumarumayae – is derived from the Aboriginal language of the Malgana people, meaning “ancient home”, a reference to stromatolites being of ancient origin in Earth’s history.

Untuk tujuan ini dan bekerja sama dengan pakar bahasa Malgana terkemuka dunia, Kymberley Oakley, dan para tetua Aborigin, sebuah nama diberikan untuk arkeon Asgard baru kami dari bahasa masyarakat Malgana: Nerearchaeum marumarumayae. Nama spesies – marumarumayae – berasal dari bahasa Aborigin masyarakat Malgana, yang berarti “rumah kuno”, sebagai referensi bahwa stromatolit berasal dari zaman purba dalam sejarah Bumi.

Weaving Aboriginal language into the naming of our new microbe represents a fitting connection between unique Aboriginal culture in Australia and the ancient microbe discovered that calls the mats of Gathaagudu “home”.

Menjalin bahasa Aborigin ke dalam penamaan mikroba baru kami merupakan hubungan yang sesuai antara budaya Aborigin yang unik di Australia dan mikroba kuno yang ditemukan yang menyebut hamparan Gathaagudu sebagai “rumah”.

Gathaagudu is under threat from global change, from increased heatwaves, cyclonic events and human activity. And among the values to preserve and conserve are the significant Aboriginal connections as well as the trails of life going back through evolutionary time.

Gathaagudu terancam oleh perubahan global, dari peningkatan gelombang panas, peristiwa siklon, dan aktivitas manusia. Dan di antara nilai-nilai yang harus dilestarikan dan dilindungi adalah hubungan Aborigin yang signifikan serta jejak kehidupan yang kembali melalui waktu evolusi.

With our study we have peered into our past. And maybe like the Montagues and Capulets of Shakespeare, we see distant families of microbes coming together to bridge the divide and ultimately form the early eukaryotes that eventually led to us: a fragile branch on the evolutionary tree of life.

Dengan studi kami, kami telah melihat ke masa lalu kami. Dan mungkin seperti Montagues dan Capulets dari Shakespeare, kami melihat keluarga mikroba yang jauh berkumpul untuk menjembatani perpecahan dan pada akhirnya membentuk eukariota awal yang pada akhirnya mengarah kepada kita: cabang rapuh pada pohon evolusi kehidupan.

Brendan Paul Burns receives funding from the Australian Research Council.

Brendan Paul Burns menerima pendanaan dari Australian Research Council.

Kymberley Oakley does not work for, consult, own shares in or receive funding from any company or organisation that would benefit from this article, and has disclosed no relevant affiliations beyond their academic appointment.

Kymberley Oakley tidak bekerja untuk, berkonsultasi, memiliki saham di, atau menerima pendanaan dari perusahaan atau organisasi apa pun yang akan mendapat manfaat dari artikel ini, dan tidak mengungkapkan afiliasi relevan selain jabatan akademiknya.

Read more